Webページのバックアップ

たまに時間があるとき、管理している何カ所かのWebの全バックアップを行います。
と言ってもpublic_html以下を今日の日付を付けたフォルダにだだ〜っとFFFTPでDLするだけですが…。

ところが、なぜか（誰かが書き込みをしてファイルをロックしている？）途中で何度か止まります。全く進まなくなるので仕方なくキャンセルし、再び同じ操作をします。
オプションとして「新しければコピー」を選んでいるので、全く同じ操作でもDL済みのファイルはスキップしてくれます。

が…、キャンセルを押したときより確実に残りファイルが少なくなっています。…様な気がします。1000数百有るのでコピーされずにスキップされたファイルがあるのかどうか、確かめられませんが…。